La Federación se rige por el sistema de autogobierno y el principio de representación democrática a través de los siguientes órganos de gobierno:

Órganos Asociativos: Asamblea

La Asamblea de FAMMA-Cocemfe Madrid es el máximo órgano de gobierno de la Federación y está integrada por:

- Los miembros de la Comisión Ejecutiva
- Los delegados elegidos al efecto por las asociaciones y entidades de la Federación

Órganos Ejecutivos: Comisión Ejecutiva

- Javier Font García, presidente
- Pedro S. Moyano Martínez, vicepresidente y secretario de Organización
- Antonio Sánchez López, secretario de Economía y Finanzas
- Fuencisla Martín Herranz, secretaria de Relaciones Externas y Coordinación Territorial
- Manuel Rancés Jofre, secretario de Accesibilidad
- Antonio Ignacio Torralba Gómez-Portillo, secretario de Sanidad
- María Julieta Hough, vocal
- Fernando Moreno Pizarro, vocal

Organigrama Asociativo

Organigrama Funcional